dependency package version issues

Author: WPZgithub

run_CEFCON.sh

@@ -4,4 +4,4 @@ input_exp="./example_data/exp_hESC_hvg1000.csv"
 input_prior="./prior_data/network_human.zip"
 input_genesDE="./example_data/DE_hESC_hvg1000.csv"
 
-python CEFCON.py --input_expData $input_exp --input_priorNet $input_prior --input_genesDE $input_genesDE --cuda 3 --repeats 3 --edge_threshold_param 8 --out_dir ./out_test
+cefcon --input_expData $input_exp --input_priorNet $input_prior --input_genesDE $input_genesDE --cuda 3 --repeats 3 --edge_threshold_param 8 --out_dir ./out_test

setup.py

@@ -20,7 +20,7 @@ def readme():
     entry_points={
         "console_scripts": ['cefcon = cefcon.CEFCON:main']
     },
-    python_requires="==3.10",  # >=3.10 is recommended
+    python_requires=">=3.8,<3.11",  # >=3.10 is recommended
     install_requires=[
         'numpy',
         'scipy',
@@ -39,7 +39,7 @@ def readme():
         'seaborn',
         'biomart',
         #'r',
-        'rpy2',
+        'rpy2<3.5.13',
     ],
     # package_dir={'cefcon':'cefcon'},
     license='MIT',