Skip to content

Commit cf57f82

Browse files
author
Alexis Morrissey
committed
Adding extra test file
1 parent 62c266e commit cf57f82

1 file changed

Lines changed: 18 additions & 0 deletions

File tree

testRunSEsplice.sam

Lines changed: 18 additions & 0 deletions
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -0,0 +1,18 @@
1+
@PG collate
2+
1 345 chr21 100 1 32M = 5892177 0 TTAGGAGCTCAGCCCGGCCAACACAGCGAAAC EEE<EEEE/EEEEEEEEEEEEEEEEEEAAEAE AS:i:-1 XS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:32 YT:Z:UP
3+
1 345 chr21 300 1 32M = 5771593 0 TTAGGAGCTCAGCCCGGCCAACACAGCGAAAC EEE<EEEE/EEEEEEEEEEEEEEEEEEAAEAE AS:i:-1 XS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:32 YT:Z:UP
4+
1 177 chr9 50 1 28M chr6 26379513 0 CCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC //A////A///EEEEEEEEEEEEEEEEE AS:i:10 XS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:28 YT:Z:UP
5+
1 177 chr21 103 1 28M chr6 26379513 0 CCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC //A////A///EEEEEEEEEEEEEEEEE AS:i:15 XS:i:0 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:28 YT:Z:UP
6+
2 83 chr4 500 255 32M = 153773210 -49 TGGGGAATTCTCCAGTTGCACTTGTGTGGTAA EEEEEEEEEEEEEAEEEEEEEEAEAEEEEEEE AS:i:8 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:32 YS:i:0 YT:Z:CP
7+
2 83 chr4 500 255 32M = 153773210 -49 TGGGGAATTCTCCAGTTGCACTTGTGTGGTAA EEEEEEEEEEEEEAEEEEEEEEAEAEEEEEEE AS:i:10 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:32 YS:i:0 YT:Z:CP
8+
3 163 chr21 101 255 28M = 153773227 49 CCTAATGTGGTGTATCCTGGGGAATTCT EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAEEEEE AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:28 YS:i:0 YT:Z:CP
9+
3 163 chr2 101 255 28M = 153773227 49 CCTAATGTGGTGTATCCTGGGGAATTCT EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAEEEEE AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:28 YS:i:0 YT:Z:CP
10+
3 163 chr4 500 255 28M = 153773227 49 CCTAATGTGGTGTATCCTGGGGAATTCT EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAEEEEE AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:28 YS:i:0 YT:Z:CP
11+
3 163 chr4 500 255 28M = 153773227 49 CCTAATGTGGTGTATCCTGGGGAATTCT EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAEEEEE AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:28 YS:i:0 YT:Z:CP
12+
4 163 chr2 103 255 28M = 153773227 49 CCTAATGTGGTGTATCCTGGGGAATTCT EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAEEEEE AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:28 YS:i:0 YT:Z:CP
13+
4 163 chr4 500 255 28M = 153773227 49 CCTAATGTGGTGTATCCTGGGGAATTCT EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAEEEEE AS:i:-7 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:28 YS:i:0 YT:Z:CP
14+
5 163 chr21 101 255 20M20N8M = 153773227 49 CCTAATGTGGTGTATCCTGGGGAATTCT EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAEEEEE AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:28 YS:i:0 YT:Z:CP
15+
5 163 chr2 101 255 20M10N8M = 153773227 49 CCTAATGTGGTGTATCCTGGGGAATTCT EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAEEEEE AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:28 YS:i:0 YT:Z:CP
16+
5 163 chr4 500 255 20M10000N8M = 153773227 49 CCTAATGTGGTGTATCCTGGGGAATTCT EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAEEEEE AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:28 YS:i:0 YT:Z:CP
17+
5 163 chr4 500 255 28M = 153773227 49 CCTAATGTGGTGTATCCTGGGGAATTCT EEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEAEEEEE AS:i:-6 XN:i:0 XM:i:0 XO:i:0 XG:i:0 NM:i:0 MD:Z:28 YS:i:0 YT:Z:CP
18+

0 commit comments

Comments
 (0)