ChiralCarbonAuth

本项目基于重写 cinit/NeoAuthBotPlugin，用于手性碳分子认证。

功能简介

• 从 PubChem 数据库中随机抽取一个小分子。
• 提供网页接口渲染分子结构。
• 用于生成手性碳识别验证题目。

目录结构

• cmd/server：HTTP 服务入口
• cmd/build-index：基础索引生成器
• cmd/build-index-resume：带进度的索引生成器
• internal/app：共享业务逻辑（分子解析、渲染、鉴定等）

使用方法

1. 下载 SDF 数据

从 PubChem 官方 FTP 下载 .sdf 文件：

https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pubchem/Compound/CURRENT-Full/SDF/

例如下载 Compound_156500001_157000000.sdf。

2. 过滤区域数少于 5 的分子（推荐）

go run ./cmd/filter-sdf Compound_156500001_157000000.sdf Compound_filtered.sdf

输出的 Compound_filtered.sdf 会移除渲染区域数（AutoGrid 生成的格子数）小于 5 的分子。

3. 生成索引文件

直接运行基础版索引工具（推荐用 Go 版，内置手性过滤逻辑）：

go run ./cmd/build-index Compound_filtered.sdf Compound_filtered.index

如需断点续跑或超时保护，可使用带进度版本：

go run ./cmd/build-index-resume Compound_filtered.sdf Compound_filtered.index

也可以先编译再执行：

go build -o build_index ./cmd/build-index            # 基础版
go build -o build_index_resume ./cmd/build-index-resume  # 带进度版

提示：根目录的 build_index.py 会对每个分子都写偏移，不含手性/区域筛选，行数会明显偏大。要保持与过滤逻辑一致，请使用上述 Go 版本建索引。

4. 修改源码配置

打开 internal/app/handler.go，找到并修改以下行：

mol, err = pickRandomMoleculeFromIndexed("Compound_156500001_157000000.sdf", "Compound_156500001_157000000.index")

替换为你自己的 .sdf 和 .index 文件名。

5. 修改端口号（可选）

打开 cmd/server/main.go，找到：

http.ListenAndServe(":8080", nil)

可以将端口号改为需要的值，例如 27419。

6. 去除星号提示（可选）

如果想去掉网页中的星号提示，打开 internal/app/render_molecule.go，修改相关渲染逻辑。

7. 运行项目

运行服务器：

go run ./cmd/server

或先编译：

GOOS=linux GOARCH=amd64 CGO_ENABLED=0 go build -o ./startAuth ./cmd/server
./startAuth

访问浏览器：

http://127.0.0.1:8080

注意事项

• .sdf 和 .index 文件需要在正确路径下，或使用绝对路径。
• .sdf 文件较大，建议选用部分数据进行测试，解压后的文件5-10g。
• 部署到服务器时需开放对应端口。